1. `Historia`: Organizacja została założona w 1915 roku przez robotnika portowego o nazwisku Harukichi Yamaguchi. W początkowym okresie grupa składała się z 50 członków. Jej celem było pośrednictwo pracy, praca w porcie oraz angażowanie się w branżę rozrywkową. W 1925 roku Harukichi przeszedł na emeryturę i zarządzanie Yamaguchi-gumi przekazał swojemu synowi, Noboru. Drugi boss sprawował rządy do swojej śmierci w 1942 roku. Przez 4 lata w szeregach organizacji brakowało przywódcy, jednak funkcjonowała ona nadal.
2.  
3. Trzecim szefem został wybrany w 1946 roku Kazuo Taoka, zwany "Niedźwiedziem". Za jego rządów Yamaguchi-gumi prowadził szczególnie agresywną ekspansję, wchłaniając część mniejszych organizacji przestępczych. Gang podejmował również starania, aby pewien procent przychodów pochodził z legalnych źródeł. Tym sposobem zrodziły się przedsiębiorstwa budowlane oraz zajmujące się przemysłem filmowym i muzycznym, kontrolowane przez gang. Jedno z nich, Kōbe Geinōsha (Agencja Promocji Sztuk Widowiskowych w Kobe) należało do najbardziej wpływowych ówcześnie agencji artystycznych w Japonii. Zamknięte zostało w 1964 roku, po siedmiu latach działalności, gdy coraz bardziej na sile przybierała ogólnokrajowa ofensywa przeciwko przestępczości zorganizowanej.
4.  
5. Czwartym bossem Yamaguchi-gumi został w 1984 roku Masahisa Takenaka, jednak został szybko zastąpiony przez Yoshinoriego Watanabe w 1989 roku. Ten ostatni został pozbawiony stanowiska w 2005 roku w wyniku bezkrwawego przewrotu w łonie organizacji, w wyniku którego przywódcą został Kinzo Kozato (Jaguar). Sprawuje on władzę do tej pory. Jego przedsięwzięcia od początku cechowały się szczególną brutalnością, prowokując wzmożone akcje policji, próbującej rozbijać organizacje przestępcze.